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3D影像來了!新冠病毒原來長這樣 |
2021年01月24日 17:54 來源:新華社 作者:彭茜 編輯:徐世杰 |
新華社北京1月23日電(記者彭茜)新冠疫情肆虐全球,小小病毒如何感染全球近億人? 第一次,包括中國科研人員在內(nèi)的一支國際團(tuán)隊“拍攝”到新冠病毒3D影像。 在納米尺度的圖像上,平均直徑不到100納米的新冠病毒像一顆奇異的星球,表面分布著可以自由擺動的刺突蛋白“觸手”。在“星球”內(nèi)部,超長的核糖核酸(RNA)鏈致密纏繞在有序排列的核糖核蛋白復(fù)合物(RNP)上。 1月21日,這一由清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院李賽實(shí)驗室和奧地利Nanographics公司、沙特阿拉伯阿卜杜拉國王科學(xué)技術(shù)大學(xué)伊萬·維奧拉團(tuán)隊合作的新冠病毒高清科普影像出爐。 對人類來說,新冠病毒是個“既熟悉又陌生”的存在。它和嚴(yán)重急性呼吸綜合征(SARS)冠狀病毒、中東呼吸綜合征(MERS)冠狀病毒同屬冠狀病毒大家庭,是過去18年里第三種導(dǎo)致人類大規(guī)模感染的冠狀病毒。 新冠病毒主要通過病毒表面的刺突蛋白spike與人體ACE2受體結(jié)合感染人體。刺突蛋白像一把“鑰匙”,細(xì)胞上的ACE2受體則像一把“鎖”。鑰匙開了鎖,病毒才能進(jìn)入細(xì)胞。開發(fā)新冠疫苗的主要目標(biāo)也正是阻止鑰匙打開鎖,以防病毒感染細(xì)胞。 最新3D影像展示了新冠病毒入侵人體細(xì)胞的過程:在入侵的那一刻,新冠病毒與受體結(jié)合,并與細(xì)胞膜發(fā)生了膜融合。 李賽研究團(tuán)隊23日向記者介紹,研究發(fā)現(xiàn)刺突蛋白具有柔性,可以像鏈錘一樣在病毒表面自由擺動。刺突蛋白擺動的特征會讓新冠病毒在攻擊細(xì)胞時更具靈活性,有利于刺突蛋白同細(xì)胞上的ACE2受體結(jié)合。 視頻形象展現(xiàn)了刺突蛋白與新冠病毒膜切線垂線的夾角,以及刺突蛋白在病毒膜表面擺動的角度范圍。 早在去年9月15日,國際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》雜志就在線發(fā)表了清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院李賽實(shí)驗室與浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院傳染病診治國家重點(diǎn)實(shí)驗室李蘭娟院士課題組的合作成果。 他們利用冷凍電鏡斷層成像和子斷層平均重構(gòu)技術(shù)成功解析了新冠病毒的全病毒三維結(jié)構(gòu)。這一研究成果,為最新的3D病毒科普影像提供了基礎(chǔ)。 經(jīng)多聚甲醛滅活后的新冠病毒冷凍電鏡圖片(李賽實(shí)驗室供圖) 在清華大學(xué)的實(shí)驗室中,滅活新冠病毒被置于冷凍電鏡下,每旋轉(zhuǎn)3°拍攝一張照片,總共拍攝41張,隨后進(jìn)行立體重構(gòu),就像給病毒做“全身CT檢查”。 團(tuán)隊還向病毒內(nèi)部“打手電”,穿過囊膜,清晰地照亮了病毒內(nèi)部核糖核蛋白復(fù)合物的排列結(jié)構(gòu),展示出迄今為止最完整的新冠病毒形象。 冷凍透射電鏡是目前結(jié)構(gòu)生物學(xué)廣泛使用的科研利器,它以電子為“光源”穿透病毒樣品,以獲得病毒內(nèi)部的結(jié)構(gòu)信息。 滅活新冠病毒全病毒三維精細(xì)結(jié)構(gòu)(李賽實(shí)驗室供圖) 基于冷凍電鏡斷層成像和子斷層平均重構(gòu)技術(shù)解析的病毒結(jié)構(gòu),國際研究團(tuán)隊利用3D渲染技術(shù)制作出了精細(xì)的新冠病毒3D影像,讓我們得以一窺病毒的內(nèi)外全貌。不過,需要注意的是,視頻中病毒對比鮮明的顏色并不代表其真實(shí)顏色,只是3D渲染的效果。 對新冠病毒結(jié)構(gòu)的解析,也讓疫苗和中和抗體研發(fā)更加“有的放矢”。比如,李賽團(tuán)隊觀察到新冠病毒表面的刺突蛋白分布隨機(jī),且處于多種狀態(tài)。如此復(fù)雜的抗原分布,使得在開發(fā)疫苗和中和抗體時,必須考慮刺突蛋白在病毒表面的具體分布和結(jié)構(gòu)。 李賽告訴記者,此前有機(jī)構(gòu)發(fā)布了一些關(guān)于新冠病毒的假想3D模型,但存在大量錯誤,比如刺突蛋白的分布和病毒整體的比例不對。研究團(tuán)隊希望能讓病毒形象的每一個細(xì)節(jié)都尊重病毒的前沿科研發(fā)現(xiàn)。 李賽團(tuán)隊照片(李賽實(shí)驗室供圖) 去年8月,看到李賽實(shí)驗室提交在生命科學(xué)預(yù)印本論文平臺bioRxiv的科研成果后,沙特阿拉伯阿卜杜拉國王科學(xué)技術(shù)大學(xué)的計算機(jī)視覺團(tuán)隊主動聯(lián)系,希望可以共同創(chuàng)作更科學(xué)、更真實(shí)的新冠病毒科普影像。 雙方一拍即合,利用各自的結(jié)構(gòu)生物學(xué)、病毒學(xué)特長和圖像處理及編程優(yōu)勢,經(jīng)過數(shù)月遠(yuǎn)程溝通構(gòu)造了病毒的真實(shí)3D影像,并由奧地利Nanographics公司最終制作成視頻。 “這并不是一個可以發(fā)表論文的成果,但我們花了如此多時間制作這些新冠病毒影像材料的初衷,就是為了展現(xiàn)病毒真實(shí)形象,并免費(fèi)提供給全世界作為疫情防控宣傳和科普教育材料。”李賽說,在一些國家仍有人質(zhì)疑新冠病毒的真實(shí)存在,這些影像將是證明病毒存在的科學(xué)論據(jù)。 |
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